Іконостас Іллінської церкви – це один з трьох іконостасів XVIII ст., що збереглися на Чернігівщині до сьогодні. Він був встановлений в храмі в 1774 р. при архімандриті Троїцько-Іллінського монастиря Іоілі Биковському.

Іконостас дерев’яний, різьблений, виконаний в стилі бароко з елементами рококо. Різьблення накладне, наскрізне, з високим рельєфом із липового дерева, вкрите левкасом. Має складну зиґзагоподібну конструкцію, обумовлену невеликою шириною храму і необхідністю розмістити троє воріт та ікони.

Іконостас має сім ярусів, враховуючи нижній цокольний ярус та верхню ікону з Розп’яттям, але без завершення, яке являє собою різьблений медальйон у картуші з променями. Медальйон не є первинним, він зроблений у ХХ ст. на заміну втраченого і живопису не має. Разом із цим новим завершенням іконостас має висоту 12 м. В іконостасі було 45 ікон, але збереглася лише 31 ікона.